蒙古军队于公元1219年在阿尔泰山南坡、额尔齐斯河和乌伦古河之发源地附近集中。这里地势雄伟，是这次人为的风暴酝酿蓄积的天作地合之地。北面，阿尔泰山，山峰峭拔错落，像一面屏障屹立高耸。山上海拔1000米至2400米处是葱郁的森林，西伯利亚落叶松和天山冷杉互相混杂，雪松、欧洲山杨、杨树和柳树更是比比皆是。在海拔1000米以下，有水草丰美的牧场，至今还有人到这里来放牧。发源于阿尔泰。山的河流，越过级级岩石，形成级级瀑布，跳跃滚落而下。清澈碧绿的流水穿过碧绿的森林和草地，所过之处，树林和草地显得更加青翠欲滴。额尔齐斯河就是如此。这条河从阿尔泰山流下，很快就转而向西，向西伯利亚奔腾而去，河水深广，清澈透明。稍南，与额尔齐斯河流向平行的是乌伦古河。与额尔齐斯河不同的是，乌伦古河沿岸多生柳丛，河水下山以后很快就流人一个没有什么植物的丘陵地区。这个丘陵地区是准噶尔盆地的边缘地带。蒙古军队从那里进入位于塔尔巴哈台山下的叶密立河河谷，然后通过位于巴尔鲁克山和阿拉套山之间的“准噶尔盆地大门”，进入谢米列奇耶（或日杰惕速）平原，即所渭“七河地区”。
七河地区是哈刺鲁突厥人的地盘。本书前文已经介绍过，哈刺鲁国王阿儿思兰已经归顺了成吉思汗，成了蒙古的藩属。当蒙古军队来到位于今勒普辛斯克市与科帕尔市之间的合牙里黑时，阿儿思兰即领兵来会，愿帮助征伐。在合牙里黑与蒙古军队会师的还有两支军队，一支由蒙古皇帝成吉思汗的附庸畏兀儿亦都护巴尔术率领，一万人二从吐鲁番而来。另一支军队由成吉思汗的附庸阿力麻里国（在今固尔扎附近）国王速格纳黑串领。这时蒙古军队大约有15万到20万人。
成吉思汗命令他的最小的弟弟帖木格斡惕赤斤留守蒙古大营；命众妃之一忽阑伴驾，给他在征战中解闷；命在过去的征战中已表现出杰出将才的几位将领率领前队人马：者别为先锋，继者别之后是速别额台所率人马，继速别额台之后是脱忽察儿所率部队。
面对蒙古军队的威胁，花刺子模帝国苏丹漠罕默德将军队分散部署于位于北疆（锡尔河一线）和东部边界（费尔干纳附近）的主要城市。他之所以如此部署，是因为他不知道蒙古军队将从何处发起进攻。他把其余的军队分别调去驻守河中地区各要塞（如不花刺和撒马尔罕）和原花刺子模各要塞（例如基发附近的乌尔妈赤）。
这种分兵御敌的战略造成了这样一种局面：尽管花刺子模军队总人数多于蒙古军队，处于优势，但每一个要塞守军的人数却又少于蒙古军队，处于劣势。
锡尔河是花刺子模帝国的北界。这条大河全长2800公里，在忽班，11月至次年3月为浅水时期，河水流量每秒386立方米；6月左右为深水时期，河水流量为每秒1343立方米。从今之土耳其斯坦市起，该河就变成了一条沙漠河流，因为该河流经土耳其斯坦市时，只有南岸是沙漠，而从土耳其斯坦以下，该河的两岸就都是沙漠地区了。成吉思汗于公元1219年秋发起的进攻就是从土耳其斯坦附近开始的。蒙古军队从谢米列奇耶地区出发，通过位于亚历山大山与合刺套山之间的阿卢里耶阿塔河谷，全军突然出现在讹答刺城前。讹答刺位于锡尔河北岸腐北面的今土耳其斯坦市仅80公里之遥。
成吉思汗命令他的两个儿子察合台和窝阔台率领一支军队在畏兀儿王巴尔术的协助下攻这个城市。察合台等围攻了很长时间才攻下该城，因为该城的城主就是那个在上一年杀害成吉思汗所派商队人员的亦纳勒术。亦纳勒术知道自己没有任何被宽恕的希望，遂拼死守城顽抗。城市被攻破以后，他还在该城中心城堡中坚持抵抗了一个月。最后，他在四面受到围攻的情况下，仍率从卒二人登屋格斗。转眼间二从卒亦亡，他便孤身一人奋战，接过妇女们从墙头递来的砖头猛掷蒙古兵，发疯似地抵抗，终因寡不敌众，被蒙古军抓住、捆绑、押至成吉思汗面前。为了替死于亦纳勒术贪婪的屠刀下的蒙古商人报仇，成吉思汗命令将生银熔化，用熔银灌注亦纳勒术的两耳。
第二支蒙古军队由成吉思汗的长子术赤率领。术赤率部沿锡尔河左岸进发，来到昔格纳黑城（今土耳其斯坦市对面）前下营。术赤派一个名叫哈散哈只的穆斯林前去劝降，要城内军民放弃抵抗，打开城门。但是，那些城民根本不听来使的话，而且将这位来使处死了（据说他们是以真主的名义处死来使的）。于是，术赤命令立即攻城，并严令城未攻破以前不许停止战斗。前队攻得疲惫了，后队立即冲上去取而代之。就这样，经过7整天连续不断的轮番冲锋，蒙古军队终于攻进了昔格纳黑市，进城杀死了所有的居民。
攻陷昔格纳黑以后，术赤又率部继续前进，来到位于今彼罗夫斯克附近的忽班的城下。忽班的城的居民以为该城城墙高而固，足以为恃，但不久，他们的这种信心就消失了，随之而来的是惶恐不安，蒙古军架起云梯，爬上城墙，从四面八方攻人城内，鉴于忽班的居民没有抵抗，术赤决定饶他们不死，但强迫居民放弃城市7天，听任蒙古军洗劫。随后，他委任一位由归顺他的父汗成吉思汗的穆斯林为该城城主，留他在此管理城市。这个穆斯林就是前文曾提到的阿里火者。
在成吉思汗的长子术赤连克锡尔河下游各城的同时，另一支蒙古军（5000人）在阿刺黑那额、速格秃扯儿必和塔孩的率领下溯锡尔河而上，挺进锡尔河上游地区，向位于塔什干西面的别纳客忒城发起进攻。这个要塞的守军是属于康里部的突厥雇佣军。这些雇佣兵抵抗了3天，终于支持不住，请求投降。蒙古军准予投降，答应饶他们不死。但是，当这些雇佣军投降，城内居民被赶出城以后，蒙古军就将他们同市民分开，然后用刀和箭处死了他们。接着，蒙古人将市民中的工匠分配到蒙古军各队，然后驱赶着年轻力壮的市民前去围攻别的要塞据点。
阿刺黑等人率领的这支军队继续溯锡尔河而上，来到费尔干纳前的忽班城下。
忽班城主是当时最著名的突厥勇士之一，名叫帖木儿灭里（即“铁王”之意）。帖本儿灭里率领1000名精兵退守位于锡尔河中心的城堡。鉴于帖木儿灭里要顽抗到底，成吉思汗便向这里增派了2万名蒙古军和5万名战俘，命这支援军来帮助阿刺黑那颜等攻城。5万名战俘被编成班相连，分别由蒙古军官率领，前往12公里以外的山地运来石块，将石块投入河水中。帖木儿灭里则命人造了一些巨大的装甲船只（在忽班，锡尔河宽130米），每天派一些士兵乘这种船来到岸边，向蒙古军放箭。但最后，帖木儿灭里再也无技可施了，便带着亲信借助他的小舰队逃出忽班，顺锡尔河而下。蒙古军早有防备，在河上横拉了一条铁链，想凭此阻拦住帖木儿灭里。但小舰队撞断了铁链，继续顺流而去。但是，这个小舰队到达忽班的附近时，发现术赤早已用船只横排于河上，组成了一道“拦河坝”。“铁王”一看大事不好，还没等小舰队靠近“拦河坝”，便弃舟登岸，飞身跨上一匹战马。纵马飞驰，穿过克齐尔库姆（即“红沙区”之意沙漠而去。蒙古人试图追上他，但未能如愿。
这个例子证明，花刺子模军队并不乏英雄气概。但他们的统帅指挥无方。前文已说过，花刺子模帝国的军队被分散部署在各个要塞，这就注定他们要消极被动地挨打，大批地被歼。